Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL1Q8IU54 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms