Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP1Q7Z6B7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms