Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPP1R42Q7Z4L9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R42Q7Z4L9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms