Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms