Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM43Q6ZSC3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms