Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms