Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms