Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms