Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms