Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO38Q6PIJ6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO38Q6PIJ6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms