Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFCAB12Q6NXP0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms