Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HMBOX1Q6NT76 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms