Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NIPBLQ6KC79 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.272e-8■□□□□ 11
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NIPBLQ6KC79 CXXC5-207ENST00000504944 568 ntTSL 312.53□□□□□ -0.42e-8■□□□□ 11
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NIPBLQ6KC79 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.662e-8■□□□□ 11
NIPBLQ6KC79 SIL1-208ENST00000505945 250 ntTSL 1 (best)10.45□□□□□ -0.742e-8■□□□□ 11
NIPBLQ6KC79 MIR4435-2HG-212ENST00000444301 666 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.812e-8■□□□□ 11
NIPBLQ6KC79 ATAD3B-203ENST00000472194 4314 ntTSL 1 (best)8.36□□□□□ -1.072e-8■□□□□ 11
NIPBLQ6KC79 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.152e-8■□□□□ 11
NIPBLQ6KC79 NSMAF-201ENST00000038176 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.172e-8■□□□□ 11
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