Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD5Q6GMV2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD5Q6GMV2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD5Q6GMV2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD5Q6GMV2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD5Q6GMV2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD5Q6GMV2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD5Q6GMV2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD5Q6GMV2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD5Q6GMV2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD5Q6GMV2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD5Q6GMV2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMYD5Q6GMV2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD5Q6GMV2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms