Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms