Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms