Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOCADQ5VW36 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms