Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf135Q5VTT2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms