Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms