Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms