Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms