Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
FRMPD1Q5SYB0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms