Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms