Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms