Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms