Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms