Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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