Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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SNAPC1Q16533 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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SNAPC1Q16533 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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SNAPC1Q16533 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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