Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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