Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
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