Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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