Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms