Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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