Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRRQ15256 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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PTPRRQ15256 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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PTPRRQ15256 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PTPRRQ15256 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PTPRRQ15256 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PTPRRQ15256 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PTPRRQ15256 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PTPRRQ15256 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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PTPRRQ15256 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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PTPRRQ15256 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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PTPRRQ15256 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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