Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms