Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
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