Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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