Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNQ14247 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNQ14247 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms