Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms