Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMB3Q13751 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms