Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
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CUL1Q13616 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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CUL1Q13616 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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CUL1Q13616 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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CUL1Q13616 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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CUL1Q13616 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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