Protein–RNA interactions for Protein: Q13530

SERINC3, Serine incorporator 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC3Q13530 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms