Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms