Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IKZF1Q13422 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms