Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
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