Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
GRIN2BQ13224 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
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