Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SEMA3BQ13214 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SEMA3BQ13214 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SEMA3BQ13214 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SEMA3BQ13214 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SEMA3BQ13214 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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