Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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TRAF3Q13114 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF3Q13114 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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