Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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