Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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